Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP47Q96K76 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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