Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGAM5Q96HS1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PGAM5Q96HS1 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGAM5Q96HS1 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGAM5Q96HS1 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGAM5Q96HS1 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGAM5Q96HS1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGAM5Q96HS1 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGAM5Q96HS1 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGAM5Q96HS1 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGAM5Q96HS1 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGAM5Q96HS1 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PGAM5Q96HS1 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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