Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
STAMBPL1Q96FJ0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms