Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY4

TMA16, Translation machinery-associated protein 16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMA16Q96EY4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMA16Q96EY4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms