Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM12Q96EX1 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms