Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHFRQ96EP1 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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