Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC10Q969S8 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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