Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1Q92616 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 RN7SL340P-201ENST00000470792 296 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCN1Q92616 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms