Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CTTNBP2Q8WZ74 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTTNBP2Q8WZ74 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms