Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ19

KCTD13, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13Q8WZ19 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCTD13Q8WZ19 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms