Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SELENOMQ8WWX9 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SELENOMQ8WWX9 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SELENOMQ8WWX9 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SELENOMQ8WWX9 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SELENOMQ8WWX9 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SELENOMQ8WWX9 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SELENOMQ8WWX9 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SELENOMQ8WWX9 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SELENOMQ8WWX9 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SELENOMQ8WWX9 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SELENOMQ8WWX9 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SELENOMQ8WWX9 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SELENOMQ8WWX9 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SELENOMQ8WWX9 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SELENOMQ8WWX9 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SELENOMQ8WWX9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SELENOMQ8WWX9 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SELENOMQ8WWX9 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SELENOMQ8WWX9 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SELENOMQ8WWX9 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms