Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC12Q8WUD4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms