Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS4

CLHC1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1Q8NHS4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLHC1Q8NHS4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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