Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms