Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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TTC29Q8NA56 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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TTC29Q8NA56 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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TTC29Q8NA56 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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TTC29Q8NA56 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TTC29Q8NA56 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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TTC29Q8NA56 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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TTC29Q8NA56 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTC29Q8NA56 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTC29Q8NA56 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTC29Q8NA56 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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