Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLIP4Q8N3C7 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLIP4Q8N3C7 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLIP4Q8N3C7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLIP4Q8N3C7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CLIP4Q8N3C7 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CLIP4Q8N3C7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CLIP4Q8N3C7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CLIP4Q8N3C7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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CLIP4Q8N3C7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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