Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
P3H3Q8IVL6 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
P3H3Q8IVL6 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P3H3Q8IVL6 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
P3H3Q8IVL6 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
P3H3Q8IVL6 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
P3H3Q8IVL6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P3H3Q8IVL6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
P3H3Q8IVL6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
P3H3Q8IVL6 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P3H3Q8IVL6 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P3H3Q8IVL6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P3H3Q8IVL6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
P3H3Q8IVL6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
P3H3Q8IVL6 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
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