Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BHLHA9Q7RTU4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms