Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms