Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP34Q70CQ2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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