Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD4L3Q6VB84 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms