Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms