Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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C9orf135Q5VTT2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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C9orf135Q5VTT2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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C9orf135Q5VTT2 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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C9orf135Q5VTT2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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C9orf135Q5VTT2 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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C9orf135Q5VTT2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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C9orf135Q5VTT2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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C9orf135Q5VTT2 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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C9orf135Q5VTT2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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C9orf135Q5VTT2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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C9orf135Q5VTT2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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C9orf135Q5VTT2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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C9orf135Q5VTT2 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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