Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PERM1Q5SV97 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms