Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms