Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms