Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC153Q494R4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms