Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL38Q2WGJ6 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms