Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP2B3Q16720 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP2B3Q16720 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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