Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SGCBQ16585 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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