Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms