Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK7Q16549 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms