Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLFQ16534 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLFQ16534 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HLFQ16534 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HLFQ16534 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLFQ16534 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLFQ16534 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLFQ16534 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLFQ16534 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLFQ16534 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLFQ16534 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLFQ16534 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLFQ16534 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLFQ16534 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLFQ16534 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLFQ16534 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HLFQ16534 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLFQ16534 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLFQ16534 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HLFQ16534 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HLFQ16534 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HLFQ16534 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HLFQ16534 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLFQ16534 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLFQ16534 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLFQ16534 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLFQ16534 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLFQ16534 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLFQ16534 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLFQ16534 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLFQ16534 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLFQ16534 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLFQ16534 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HLFQ16534 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLFQ16534 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLFQ16534 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLFQ16534 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLFQ16534 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HLFQ16534 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HLFQ16534 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLFQ16534 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLFQ16534 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HLFQ16534 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HLFQ16534 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLFQ16534 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLFQ16534 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLFQ16534 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HLFQ16534 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLFQ16534 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLFQ16534 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HLFQ16534 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLFQ16534 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLFQ16534 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLFQ16534 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLFQ16534 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLFQ16534 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLFQ16534 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLFQ16534 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLFQ16534 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HLFQ16534 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLFQ16534 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLFQ16534 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLFQ16534 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms