Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PSMD5Q16401 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMD5Q16401 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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