Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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PUM3Q15397 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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PUM3Q15397 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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PUM3Q15397 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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PUM3Q15397 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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PUM3Q15397 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
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PUM3Q15397 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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PUM3Q15397 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PUM3Q15397 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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