Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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