Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK13Q14004 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms