Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CBFBQ13951 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms