Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DDX39BQ13838 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DDX39BQ13838 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DDX39BQ13838 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DDX39BQ13838 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DDX39BQ13838 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DDX39BQ13838 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DDX39BQ13838 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DDX39BQ13838 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DDX39BQ13838 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DDX39BQ13838 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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DDX39BQ13838 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DDX39BQ13838 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DDX39BQ13838 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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DDX39BQ13838 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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DDX39BQ13838 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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DDX39BQ13838 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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DDX39BQ13838 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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