Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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