Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PTCH1Q13635 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTCH1Q13635 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms