Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX6Q13608 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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