Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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NAE1Q13564 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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NAE1Q13564 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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NAE1Q13564 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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NAE1Q13564 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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NAE1Q13564 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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NAE1Q13564 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NAE1Q13564 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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NAE1Q13564 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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NAE1Q13564 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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