Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNTB2Q13425 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms