Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CLN3Q13286 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CLN3Q13286 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CLN3Q13286 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CLN3Q13286 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CLN3Q13286 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CLN3Q13286 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CLN3Q13286 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CLN3Q13286 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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