Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALCOCO2Q13137 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms