Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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