Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXC1Q12948 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXC1Q12948 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXC1Q12948 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXC1Q12948 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXC1Q12948 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXC1Q12948 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXC1Q12948 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXC1Q12948 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXC1Q12948 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXC1Q12948 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXC1Q12948 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXC1Q12948 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXC1Q12948 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXC1Q12948 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXC1Q12948 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXC1Q12948 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXC1Q12948 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXC1Q12948 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXC1Q12948 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXC1Q12948 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXC1Q12948 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXC1Q12948 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXC1Q12948 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXC1Q12948 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXC1Q12948 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXC1Q12948 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXC1Q12948 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXC1Q12948 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms