Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIN2AQ12879 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms