Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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